More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001050 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  95.02 
 
 		 244 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  65.33 
 
 		 222 aa  267  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  60.8 
 
 		 222 aa  255  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  63.32 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  62.56 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  61.98 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  62.56 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  62.56 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  62.56 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  62.56 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  61.14 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  57.34 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  60.62 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  60.62 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  58.71 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.21 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  47.24 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  39.62 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  43.22 
 
 		 256 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  40.7 
 
 		 256 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 256 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  45.45 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 256 aa  167  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  44.44 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  40.2 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  43 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  46.67 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.12 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  38.68 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  42.71 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  42.93 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.41 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  44.67 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 345 aa  165  4e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.21 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  43.22 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  43.65 
 
 		 268 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  41.18 
 
 		 277 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 256 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.29 
 
 		 604 aa  164  8e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  44.06 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  37.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  42 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  47.21 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  45.64 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  45.13 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.12 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  43.22 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  45.73 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  39.73 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  42.21 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 250 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.39 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  42 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.5 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  40.49 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  42.42 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  39.62 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  39.7 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  40.48 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  40.2 
 
 		 455 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  39.9 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  45.23 
 
 		 246 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 253 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.42 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  41.79 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  37.56 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>