More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2864 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  85.52 
 
 
246 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  82.4 
 
 
240 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  83.04 
 
 
232 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  84.62 
 
 
263 aa  390  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  85.52 
 
 
240 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  85.52 
 
 
246 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  85.52 
 
 
246 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  85.52 
 
 
246 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  84.16 
 
 
253 aa  390  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  82.43 
 
 
247 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  82.81 
 
 
246 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  82.81 
 
 
247 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  82.81 
 
 
247 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  83.26 
 
 
246 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  81.42 
 
 
243 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  70.72 
 
 
241 aa  329  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  71.04 
 
 
247 aa  327  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  68.33 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  66.52 
 
 
233 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  56.62 
 
 
240 aa  258  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 
237 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  55.25 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
230 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
220 aa  250  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  54.34 
 
 
235 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  53.88 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  52.75 
 
 
226 aa  242  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  55.25 
 
 
241 aa  241  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 
219 aa  239  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.59 
 
 
258 aa  239  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
246 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.25 
 
 
242 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  50.46 
 
 
220 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.18 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  52.51 
 
 
229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  50.23 
 
 
236 aa  231  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.61 
 
 
237 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
225 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.32 
 
 
239 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
238 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
236 aa  229  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50 
 
 
238 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.64 
 
 
225 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.54 
 
 
237 aa  228  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 
224 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  51.14 
 
 
225 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50 
 
 
238 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.17 
 
 
242 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.08 
 
 
229 aa  225  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  50.24 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
224 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.4 
 
 
224 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
224 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 
222 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
248 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  50.46 
 
 
222 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
228 aa  222  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.4 
 
 
235 aa  222  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
233 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.91 
 
 
230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48.18 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
222 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.17 
 
 
266 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  51.14 
 
 
234 aa  221  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 
224 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
226 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.25 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.18 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.17 
 
 
291 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
254 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.7 
 
 
248 aa  218  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.79 
 
 
226 aa  218  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  47.71 
 
 
229 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.46 
 
 
230 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  48.4 
 
 
642 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  48.61 
 
 
239 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  47.71 
 
 
235 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.55 
 
 
253 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.95 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
229 aa  215  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>