More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1578 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  49.75 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  44.5 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  48.31 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  48.31 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  48.31 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  50.51 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  43.78 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  47.55 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  44.13 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  44.13 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  42.59 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  43.18 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  46.73 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  45.07 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  46.12 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  44.19 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  45.07 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  45.63 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  45.45 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  42.04 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  46.88 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  43.46 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.98 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.83 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.44 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.61 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  44.61 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  43.06 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  39.62 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  43.19 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 244 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.36 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  41.75 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  44.7 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  37.68 
 
 		 236 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  41.58 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  42.51 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  44.44 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  42.72 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  38.6 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  40.87 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  39.09 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2513  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  38.19 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2578  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  41.01 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04661  ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0165379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  43.72 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  37.69 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  42.79 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  41.71 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  38.5 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  42.79 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  37.67 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.55 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  39.71 
 
 		 455 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  37.69 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  37.06 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  42.79 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.37 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  38.46 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  42.79 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  39.09 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  40.69 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 		 259 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  49.44 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  39.22 
 
 		 445 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  43.38 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2307  ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00152592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2275  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2482  ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2229  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 256 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00449183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2503  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>