More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1236 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  87.44 
 
 		 223 aa  400  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  87 
 
 		 223 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  78.92 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  49.77 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  48.17 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  48.4 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  47.71 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  44.5 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  46.51 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  45.91 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  45.87 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  45.95 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  47.25 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  46.3 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  45.87 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  49.31 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  47.91 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  46.83 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  46.83 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  43.95 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  47.47 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  46.34 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.47 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  43.5 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.14 
 
 		 604 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  46.36 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.27 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.83 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  46.19 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  35.94 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  46.15 
 
 		 222 aa  168  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.99 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  39.91 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.07 
 
 		 664 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.65 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  41.52 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  42.47 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  45.23 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  37.33 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.13 
 
 		 455 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  35.91 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  37.33 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  39.63 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  42.02 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.36 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.09 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  43.72 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  40.09 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  44.55 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  38.12 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  39.55 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0348  ABC transporter related  36.53 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  40.54 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.19 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  38.99 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  41.18 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 643 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  39.27 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.55 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>