More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1813 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  57.4 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 247 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  45.85 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.48 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  43.48 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.33 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  42.92 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  44.6 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  43.27 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  42.01 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.1 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  42.5 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  41.07 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  39.74 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  43.06 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  43.08 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  40.85 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  40.65 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  37.93 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  35.98 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  36.45 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  36.57 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  41.67 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  40 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  37.2 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  36.79 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.38 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  37.28 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  35.94 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  35.98 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  36.41 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  39.47 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.68 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  35.19 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  34.93 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  35.19 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  35.51 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1200  ABC transporter related  41.05 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31235  normal  0.0871936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  38.07 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  36.28 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  38.31 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4587  cell division ATP-binding protein FtsE  37.32 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  33.49 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  33.49 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  34.58 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  38.02 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.94 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.71 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  36.41 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  36.55 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.56 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  39.67 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.56 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  34.67 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.39 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  37.56 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  36.49 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  37.38 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  34.72 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  42.2 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  36.87 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  39.89 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>