More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3904 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  95.22 
 
 		 230 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.22 
 
 		 237 aa  294  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  66.97 
 
 		 259 aa  292  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  55.96 
 
 		 221 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  51.12 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.29 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.22 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.22 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  47.14 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  46.94 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  47.14 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  45.88 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  46.91 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  48 
 
 		 242 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  46.67 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  43.72 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  45.81 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  49.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  47.09 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  45.41 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  41.23 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  47.09 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.26 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  46.97 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  42.79 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  46.97 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  45.13 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  42.27 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  41.13 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  47.03 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  42.27 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.56 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  43.59 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  43.15 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  46.15 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  44.39 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  40 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.91 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  46.43 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  41.24 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  44 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  40.7 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  37.67 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.41 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  43.37 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  46.15 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  45.5 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  38.79 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  40.89 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  40.89 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  40.89 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  43.96 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  46.39 
 
 		 260 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  46.39 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  40.83 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  44.33 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  43.65 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>