More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6457 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  65.94 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  64.19 
 
 		 230 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.23 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  60.09 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  48.98 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 		 228 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  48.47 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.65 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.65 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  49.23 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  48.45 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  49.76 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  46.5 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  47.06 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  43.12 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  46.64 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  47.94 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  50.52 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  43.98 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  47.62 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  50.52 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  43.86 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  44.34 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  41.12 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  47.62 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  41.33 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  40.31 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  49.74 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  44.71 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  47.85 
 
 		 200 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  45.54 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  41.89 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  40.45 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  41.47 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.88 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  42.56 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  39.29 
 
 		 227 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  43.48 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  40.17 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  46.7 
 
 		 232 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  43.81 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.5 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  47.45 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  46.94 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  44.79 
 
 		 224 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  38.5 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  36.53 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  46 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  43.65 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.38 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  43.65 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  46.94 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.53 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  44.59 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.65 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  45.79 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3433  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  47.45 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  46.43 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  44.44 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  45.96 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.15 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>