More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5642 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  100 
 
 		 230 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  72.07 
 
 		 248 aa  312  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  69.55 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  66.52 
 
 		 265 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  56.7 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  60.77 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  54.35 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  51.74 
 
 		 653 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.6 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.36 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  48.05 
 
 		 650 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  47.79 
 
 		 647 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 649 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  46.35 
 
 		 652 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.2 
 
 		 647 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.74 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.74 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  56.42 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  44.83 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.53 
 
 		 649 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.39 
 
 		 649 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  46.02 
 
 		 682 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  46.19 
 
 		 1130 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48.2 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  46.02 
 
 		 682 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  46.32 
 
 		 648 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.58 
 
 		 644 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  45.58 
 
 		 647 aa  195  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  46.02 
 
 		 667 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  45.58 
 
 		 656 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  47.35 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.1 
 
 		 260 aa  194  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  46.02 
 
 		 667 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.5 
 
 		 642 aa  194  7e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  48.89 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  48.28 
 
 		 655 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  46.43 
 
 		 641 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.05 
 
 		 642 aa  192  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  47.09 
 
 		 676 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 646 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  46.64 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.49 
 
 		 665 aa  192  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  46.05 
 
 		 650 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  44.74 
 
 		 652 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.09 
 
 		 648 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  44.49 
 
 		 665 aa  191  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.05 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  45.05 
 
 		 678 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  45.05 
 
 		 678 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.05 
 
 		 678 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.69 
 
 		 656 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 643 aa  190  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  50 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  46.46 
 
 		 653 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  48.46 
 
 		 671 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  46.9 
 
 		 681 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  44.89 
 
 		 653 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  46.9 
 
 		 681 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  45.54 
 
 		 641 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.95 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.15 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  46.9 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.64 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  47.37 
 
 		 647 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  46.08 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  46.9 
 
 		 687 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  42.6 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.28 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.43 
 
 		 648 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.43 
 
 		 648 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  46.09 
 
 		 666 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.05 
 
 		 648 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.58 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.47 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.29 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  45.91 
 
 		 641 aa  188  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  45.22 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.11 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  46.49 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  45.89 
 
 		 654 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>