More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1614 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  71.05 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  59.28 
 
 		 265 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  58.06 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  57.6 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  60.77 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.4 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  47.68 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.46 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.05 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.26 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.79 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.79 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.26 
 
 		 388 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  45.02 
 
 		 388 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  56 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  51.83 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  48.91 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.7 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  49.78 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.29 
 
 		 226 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  45.02 
 
 		 668 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.64 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  52.28 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.21 
 
 		 652 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.75 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.93 
 
 		 642 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  51.13 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 654 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.38 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 643 aa  192  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.52 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.09 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  48.28 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  52.27 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  43.67 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 226 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  45.54 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  46.29 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  42.29 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.86 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.13 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  47.27 
 
 		 663 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.04 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  45.54 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  46.46 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  46.05 
 
 		 652 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.5 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  45.69 
 
 		 663 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  46.22 
 
 		 650 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.95 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  46.58 
 
 		 654 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  46.5 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  46.05 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.5 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.67 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.84 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.77 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.02 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  45.29 
 
 		 641 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>