More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6490 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  48.18 
 
 		 653 aa  209  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.95 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.47 
 
 		 228 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  47.53 
 
 		 657 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.95 
 
 		 239 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 233 aa  205  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  56 
 
 		 230 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  45.16 
 
 		 224 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  52.25 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.75 
 
 		 657 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.65 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  50.89 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  51.34 
 
 		 283 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  44.44 
 
 		 656 aa  202  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  42.92 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.17 
 
 		 653 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  49.57 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 220 aa  198  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 230 aa  198  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.49 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 643 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.32 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  48.65 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 		 238 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  46.4 
 
 		 647 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 		 241 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  51.35 
 
 		 244 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 228 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.02 
 
 		 648 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 228 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  47.95 
 
 		 650 aa  195  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 658 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47 
 
 		 228 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  46.79 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 		 240 aa  195  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  42.86 
 
 		 227 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 648 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  39.46 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  56.28 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.35 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 		 648 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  47.75 
 
 		 657 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 		 648 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.91 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 		 228 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 		 228 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.05 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.45 
 
 		 646 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  44.75 
 
 		 648 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  44.75 
 
 		 648 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 		 648 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 226 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  43.04 
 
 		 240 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 		 648 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.77 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 226 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  43.15 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  41.94 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.12 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  44.19 
 
 		 228 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  41.7 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  45.13 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 226 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  40.32 
 
 		 250 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  50 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.81 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40.27 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  44.05 
 
 		 229 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.19 
 
 		 226 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.37 
 
 		 236 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 231 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  47.14 
 
 		 230 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.09 
 
 		 252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 228 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>