More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6965 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  91.15 
 
 		 283 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  68.67 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  72.07 
 
 		 230 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  62.67 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1614  ABC transporter related  58.06 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.045401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  51.98 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.4 
 
 		 642 aa  203  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.02 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  47.98 
 
 		 652 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.2 
 
 		 647 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.4 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  44.69 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.92 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  43.89 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  43.89 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  48.53 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.78 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  45.57 
 
 		 656 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.58 
 
 		 656 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 643 aa  192  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.81 
 
 		 653 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.1 
 
 		 642 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.09 
 
 		 648 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.09 
 
 		 648 aa  191  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  47.09 
 
 		 648 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.09 
 
 		 648 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.09 
 
 		 648 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  47.09 
 
 		 648 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  46.93 
 
 		 653 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  45.04 
 
 		 650 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  44.64 
 
 		 652 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 648 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.85 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.98 
 
 		 653 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.64 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  48.89 
 
 		 655 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.81 
 
 		 644 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 231 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 649 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.19 
 
 		 648 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  46.7 
 
 		 665 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  43.69 
 
 		 660 aa  188  7e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  43.21 
 
 		 650 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6490  ABC transporter related  50.23 
 
 		 301 aa  187  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0596674  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.26 
 
 		 665 aa  188  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.82 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  45.78 
 
 		 648 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44.74 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.84 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  46.19 
 
 		 647 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.43 
 
 		 649 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  44.73 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  45.62 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  46.85 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  49.09 
 
 		 660 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.43 
 
 		 649 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  43.17 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  46.93 
 
 		 666 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  44.14 
 
 		 1130 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.21 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.44 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  44.74 
 
 		 388 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  48.18 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>