More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0678 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  70.54 
 
 		 224 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  68.64 
 
 		 225 aa  302  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  57.47 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  55.4 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  55.4 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.9 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.77 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  51.38 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  51.38 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  50.92 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.92 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  51.35 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.92 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.62 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  51.13 
 
 		 254 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  51.39 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.55 
 
 		 232 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50.46 
 
 		 252 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.56 
 
 		 235 aa  224  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.55 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  50 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.08 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.03 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.45 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.18 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.67 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  47.77 
 
 		 654 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.16 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.75 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.73 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  48.2 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.64 
 
 		 653 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.91 
 
 		 255 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 658 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  46.61 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.55 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.54 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.73 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.08 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.4 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.73 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.27 
 
 		 642 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  49.32 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.71 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.18 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.12 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  49.55 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  52.8 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.63 
 
 		 280 aa  214  9e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  49.32 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.85 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  50 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.85 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.95 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  49.54 
 
 		 254 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.25 
 
 		 644 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.18 
 
 		 256 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.88 
 
 		 247 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.66 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.66 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  46.58 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  49.54 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.51 
 
 		 646 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.87 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  48.85 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.75 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  49.34 
 
 		 666 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  48.64 
 
 		 671 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.25 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.4 
 
 		 647 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.58 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  50 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  51.4 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  50.88 
 
 		 563 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.73 
 
 		 652 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45 
 
 		 234 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  47.73 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.73 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>