More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4228 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  95.22 
 
 		 230 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.91 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  65.16 
 
 		 259 aa  287  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  54.09 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  51.12 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.66 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  45.36 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.44 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.44 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  43.26 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  45.41 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  45.64 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  42.33 
 
 		 228 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  46.46 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  41.86 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  45.31 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  45.31 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  44.33 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  47.94 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  45.95 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  45.13 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  43.84 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  44.85 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  40.39 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  40.39 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  40.39 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  42.64 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  44.85 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  38.65 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  44.62 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.54 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  42.78 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  43.2 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  42.73 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  45.41 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  40.72 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.5 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  39.9 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  42.35 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  44.39 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  38.29 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  41.79 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  38.64 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  43 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  43.3 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  40.64 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  43.37 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.11 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  39.71 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  39.71 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  40 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  39.7 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  44.22 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  39.69 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.2 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  39.39 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>