More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0607 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  65.22 
 
 		 230 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  63.91 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  62.9 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  58.06 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  47.98 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.15 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.15 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  44.28 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0681  ABC transporter related  43.12 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  42.93 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  42.86 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.1 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  42.24 
 
 		 265 aa  151  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  42.79 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  42.93 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  46.32 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.15 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  39.81 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.89 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  44.67 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  42.33 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  42.33 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  42.05 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.81 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  43.3 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  45.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.33 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  44.16 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  43.23 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  38.46 
 
 		 668 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  44.1 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  45.26 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  36.63 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  41.75 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  38.36 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  41.94 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  40.21 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  39.25 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.39 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  40.2 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37.2 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  43.94 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  39.09 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  39.9 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  38.14 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  41.46 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  39.11 
 
 		 653 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  39.37 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  43.3 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  41.87 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.78 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  43.3 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  36.36 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  40.51 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.35 
 
 		 648 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  39.45 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.41 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  39.82 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  41.4 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  43.3 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  38.81 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  42.78 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  42.56 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>