More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1291 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  100 
 
 		 221 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.06 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  55.96 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  60.09 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  50.92 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  54.09 
 
 		 230 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  45.71 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  46.08 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  45.88 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  44.44 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  46.5 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  46.5 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.95 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  44.1 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  41.63 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  42.6 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.74 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  41.75 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  40.51 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  38.99 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.66 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  41.86 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  43.69 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  43.08 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  44.85 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  43.59 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.08 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  38.6 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  38.73 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  40.27 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  39.63 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.29 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  43.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  38.97 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  35.87 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  41.18 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  43.92 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  44.57 
 
 		 200 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  38.36 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  43.08 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  42.56 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  38.46 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.24 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.24 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  44.39 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  42.56 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  42.71 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.81 
 
 		 244 aa  137  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.29 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  37.16 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.9 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  43.94 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  40.72 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.27 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  42.29 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.27 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  43.68 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  43.65 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.27 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  36.99 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.81 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.27 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  38.07 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  36.99 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.72 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  40.72 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  42.19 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  40.21 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>