More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3494 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  464  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.86 
 
 
236 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  56.65 
 
 
236 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  55.22 
 
 
232 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  58.33 
 
 
236 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  55.32 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  56.6 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  57.71 
 
 
235 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  56.58 
 
 
236 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  52.7 
 
 
239 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 
236 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  53.48 
 
 
249 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  55.41 
 
 
236 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.68 
 
 
242 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 
234 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  47.14 
 
 
242 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  58.65 
 
 
215 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 
238 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  47.79 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
247 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  47.75 
 
 
237 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  52.38 
 
 
226 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
231 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
233 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  42.01 
 
 
224 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  44.84 
 
 
259 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  44.39 
 
 
221 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  40.44 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
248 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  42.98 
 
 
233 aa  142  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
242 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  43.65 
 
 
244 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  38.99 
 
 
230 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.36 
 
 
232 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  41.82 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  41.78 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.35 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.64 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  38.67 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.98 
 
 
255 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.35 
 
 
228 aa  138  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.18 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
222 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 
233 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.31 
 
 
227 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 
232 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 
232 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  41.56 
 
 
232 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  37.28 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.25 
 
 
237 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.25 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  39.21 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.25 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  42.58 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.47 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.29 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.54 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.79 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  33.33 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  36 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.78 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.47 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  36.96 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.29 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.54 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  39.19 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  35.29 
 
 
653 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.54 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.7 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  35.75 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.65 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  41.62 
 
 
231 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  41.62 
 
 
231 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 
237 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.1 
 
 
252 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.39 
 
 
235 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  43.54 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  46.11 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  36.77 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  37.67 
 
 
227 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  44.22 
 
 
251 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  45.5 
 
 
227 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  43.84 
 
 
272 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
228 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  30.59 
 
 
224 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  42.4 
 
 
261 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  35.78 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  42.5 
 
 
227 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.81 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  42.03 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  36.56 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>