More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
252 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  54.98 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  53.25 
 
 
237 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.6 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  54.15 
 
 
229 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  51.54 
 
 
233 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
229 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
223 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.57 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
230 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.87 
 
 
223 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
223 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  48.25 
 
 
272 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  39.47 
 
 
223 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  46.15 
 
 
279 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.46 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  47.84 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.93 
 
 
225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.93 
 
 
225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  42.31 
 
 
238 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  47.8 
 
 
229 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  49.78 
 
 
277 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.4 
 
 
239 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
254 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  44.54 
 
 
252 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  39.74 
 
 
229 aa  168  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
233 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.09 
 
 
255 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
229 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  41.55 
 
 
232 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  49.26 
 
 
243 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.44 
 
 
277 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
227 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.2 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  36.8 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  42.67 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  38.84 
 
 
217 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40.28 
 
 
233 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  48.6 
 
 
249 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.59 
 
 
222 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  42.79 
 
 
241 aa  165  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
235 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  45.71 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.54 
 
 
604 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.54 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  36.41 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  45.78 
 
 
563 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  40.87 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  43.75 
 
 
240 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
345 aa  163  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  42.93 
 
 
250 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
246 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
244 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  43.27 
 
 
229 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.33 
 
 
565 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  36.78 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  47.03 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  41.63 
 
 
258 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  46.57 
 
 
228 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  43.17 
 
 
227 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  41.78 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  42.79 
 
 
246 aa  161  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.9 
 
 
357 aa  161  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  39.57 
 
 
240 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  32.09 
 
 
224 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.17 
 
 
227 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  42.98 
 
 
258 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
227 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  44.66 
 
 
233 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  44.54 
 
 
219 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  40.89 
 
 
300 aa  160  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
240 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
233 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  50.22 
 
 
232 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  41.99 
 
 
252 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  38.33 
 
 
232 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  42.98 
 
 
243 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  41.95 
 
 
226 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  44.7 
 
 
229 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>