More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1857 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  65.32 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  61.61 
 
 		 225 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  57.92 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  58.11 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  57.21 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  50.23 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  48.23 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  48.23 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  47.39 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  45.91 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.55 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  43.84 
 
 		 269 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.25 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  45.41 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 244 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40.83 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  41.94 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.18 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.04 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.5 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.59 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.52 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  40.37 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.03 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.64 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  41.67 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 291 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.89 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  41.82 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.89 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  40.55 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.67 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  41.55 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  39.55 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.74 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.31 
 
 		 255 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.15 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  41.07 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  37.9 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.44 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  41.88 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  40.54 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.19 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  45.5 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  39.91 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  39.91 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.48 
 
 		 266 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  39.09 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  41.28 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  39.73 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  40.83 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  39.73 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  39.73 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  41.04 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  39.73 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  41.07 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  39.73 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.18 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  38.81 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  39.73 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>