More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1757 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  61.61 
 
 
229 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  62.05 
 
 
224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  58.3 
 
 
223 aa  249  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  55.2 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  50.68 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  50.68 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  52.7 
 
 
224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  52.7 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  50.45 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
223 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
223 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
223 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
223 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
223 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
223 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
223 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
223 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  46.82 
 
 
223 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.73 
 
 
226 aa  188  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
228 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  43.18 
 
 
236 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  40.99 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.34 
 
 
228 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  43.18 
 
 
228 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  39.27 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  38.53 
 
 
233 aa  177  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  43.38 
 
 
232 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
230 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 
222 aa  175  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.26 
 
 
230 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  40.62 
 
 
233 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.47 
 
 
235 aa  174  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
233 aa  174  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  37.33 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  42.27 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.81 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.47 
 
 
244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
220 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  37.95 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  40.43 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.01 
 
 
234 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  39.37 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  41.48 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  38.81 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.01 
 
 
234 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  41.7 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  41.67 
 
 
234 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
252 aa  170  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
279 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
255 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  41.55 
 
 
234 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  38.71 
 
 
258 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  40.37 
 
 
253 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40.54 
 
 
241 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
236 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 
229 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  42.2 
 
 
245 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
238 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  37.9 
 
 
288 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.63 
 
 
229 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
246 aa  168  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  38.74 
 
 
240 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  39.91 
 
 
238 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  36.7 
 
 
233 aa  168  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  39.45 
 
 
239 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  39.37 
 
 
236 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  39.73 
 
 
227 aa  168  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
262 aa  168  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
228 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.36 
 
 
231 aa  167  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  39.91 
 
 
243 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  39.56 
 
 
246 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  43.58 
 
 
236 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  43.24 
 
 
224 aa  167  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  42.01 
 
 
241 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.2 
 
 
244 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  40.18 
 
 
231 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
222 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.47 
 
 
239 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
229 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.89 
 
 
280 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
220 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
255 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
227 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  42.54 
 
 
234 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  41.44 
 
 
244 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  40.36 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  39.35 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  42.22 
 
 
234 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  44.12 
 
 
236 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  41.74 
 
 
225 aa  165  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  40.09 
 
 
228 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
240 aa  165  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  39.91 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>