More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2586 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  59.36 
 
 
225 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  59.36 
 
 
225 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  59.46 
 
 
223 aa  252  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  58.3 
 
 
225 aa  249  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 
231 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  52.49 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  50.23 
 
 
229 aa  218  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  48.17 
 
 
223 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
223 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  50.45 
 
 
224 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  49.55 
 
 
224 aa  208  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
230 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  42.01 
 
 
236 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  42.59 
 
 
229 aa  191  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 
237 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  46.15 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  41.3 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  46.15 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.2 
 
 
238 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.47 
 
 
226 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  43.58 
 
 
233 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.86 
 
 
888 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.64 
 
 
226 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.47 
 
 
228 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
229 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
266 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
240 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  42.01 
 
 
237 aa  177  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
236 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.07 
 
 
233 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.37 
 
 
228 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.7 
 
 
234 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  40 
 
 
240 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.47 
 
 
252 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
250 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 
221 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 
235 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  38.91 
 
 
239 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  175  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  39.46 
 
 
253 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.37 
 
 
233 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  39.19 
 
 
246 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  41.74 
 
 
279 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.72 
 
 
240 aa  174  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.92 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  38.36 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.98 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  44.39 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.27 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.63 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  40.74 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  42.01 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
643 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  40 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  41.59 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  41.1 
 
 
250 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  40.09 
 
 
269 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  39.73 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.73 
 
 
242 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  39.73 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
259 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  38.29 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  39.81 
 
 
245 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.55 
 
 
227 aa  171  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  41.18 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.65 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  39.17 
 
 
234 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.19 
 
 
230 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  40.18 
 
 
252 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  41.18 
 
 
266 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  40.18 
 
 
252 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  40.09 
 
 
249 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  37.5 
 
 
233 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  38.5 
 
 
233 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  40 
 
 
230 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  40.09 
 
 
249 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  39.35 
 
 
243 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.45 
 
 
225 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  40.27 
 
 
226 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  39.56 
 
 
236 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>