More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4150 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  463  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  76.71 
 
 
235 aa  317  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  58.93 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.64 
 
 
265 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.25 
 
 
252 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  56.05 
 
 
236 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  56.88 
 
 
229 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  51.56 
 
 
229 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  57.27 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
223 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  50 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  44.76 
 
 
234 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
244 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  42.01 
 
 
223 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  42.6 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.99 
 
 
223 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  42.34 
 
 
224 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  43.64 
 
 
244 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.18 
 
 
228 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.27 
 
 
259 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.3 
 
 
232 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  44.76 
 
 
245 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.78 
 
 
240 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  46.58 
 
 
245 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.21 
 
 
255 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
252 aa  174  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.79 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.79 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  43.4 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  42.33 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  42.4 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
286 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.15 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  42.66 
 
 
225 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.86 
 
 
249 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  43.81 
 
 
243 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
229 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  38.5 
 
 
234 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
235 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
256 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
236 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  40.37 
 
 
233 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  41.05 
 
 
234 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  41.82 
 
 
223 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  43.32 
 
 
229 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
271 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  38.5 
 
 
234 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.07 
 
 
232 aa  167  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  47.83 
 
 
660 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  42.38 
 
 
241 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.2 
 
 
251 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
266 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  41.44 
 
 
243 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  45.67 
 
 
408 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.06 
 
 
242 aa  166  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.04 
 
 
239 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
643 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.2 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  44.95 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.11 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  40.81 
 
 
244 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
238 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  42.67 
 
 
243 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
236 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
255 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  42.01 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  41.15 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  43.44 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.33 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>