More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1004 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  64.09 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  64.09 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  52.07 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  49.08 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  47.06 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  46.58 
 
 		 223 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  48.39 
 
 		 231 aa  214  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  48.62 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  45.66 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  44.8 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.01 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.72 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.58 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  38.81 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.1 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  37.79 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.72 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  37.21 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 248 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  36.02 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.07 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  40.74 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  41.4 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  35.94 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 255 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  35.91 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  39.27 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  37.9 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  36.77 
 
 		 408 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  39.52 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  38.16 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  36.65 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  37.61 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  39.07 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  37.27 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  35.62 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.01 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  38.46 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  36.36 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  34.6 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  37.44 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.36 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  37.9 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  38.18 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  37.44 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  37.73 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  35.02 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  37.73 
 
 		 277 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  36.45 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 286 aa  164  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  37.9 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  38.14 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  37.9 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  36.62 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  36.7 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  37.33 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  37.9 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  39.07 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  37.9 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  36.41 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  39.45 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  35.45 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  41.92 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>