More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1348 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  96.88 
 
 
224 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  67.27 
 
 
231 aa  308  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  58.11 
 
 
229 aa  259  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  52.7 
 
 
225 aa  250  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  58.48 
 
 
224 aa  240  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  53.74 
 
 
225 aa  238  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  53.74 
 
 
225 aa  238  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  54.21 
 
 
223 aa  229  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  50.45 
 
 
223 aa  224  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
223 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 
223 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 
223 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  46.4 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
228 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  42.66 
 
 
242 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.24 
 
 
228 aa  187  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  40.19 
 
 
233 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
244 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  43.38 
 
 
244 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  40.1 
 
 
229 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.92 
 
 
230 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  44.13 
 
 
252 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  41.2 
 
 
269 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  44.09 
 
 
234 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40 
 
 
232 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  43.9 
 
 
228 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  40.19 
 
 
230 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  42.66 
 
 
233 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  40 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  40.64 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  41.36 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  39.73 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  38.57 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  40.81 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.13 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.29 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  46.08 
 
 
217 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  39.63 
 
 
234 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
259 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40.95 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.81 
 
 
280 aa  171  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  42.66 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  41.15 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  40.28 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
250 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 
222 aa  171  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.28 
 
 
240 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  47.27 
 
 
221 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  40.93 
 
 
246 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  42.25 
 
 
240 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  47.27 
 
 
221 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  39.09 
 
 
234 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  42.01 
 
 
228 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.06 
 
 
242 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  43.06 
 
 
223 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40 
 
 
227 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
235 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
255 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 
242 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  39.91 
 
 
231 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
244 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  43.58 
 
 
234 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  39.81 
 
 
252 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  42.66 
 
 
246 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  43.58 
 
 
234 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  42.66 
 
 
242 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.59 
 
 
234 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  40.38 
 
 
240 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  39.72 
 
 
258 aa  167  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.38 
 
 
225 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  40.37 
 
 
245 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  42.47 
 
 
253 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  41.1 
 
 
225 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
228 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  42.01 
 
 
247 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  36.57 
 
 
252 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  43.81 
 
 
250 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.26 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
237 aa  166  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  42.01 
 
 
246 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.26 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.86 
 
 
264 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  42.01 
 
 
243 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  42.01 
 
 
247 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  38.21 
 
 
259 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  42.01 
 
 
247 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 
240 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  41.1 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  42.2 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>