More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3713 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  84.98 
 
 
244 aa  407  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  83.69 
 
 
240 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  82.59 
 
 
228 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  77.49 
 
 
234 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  56.44 
 
 
235 aa  257  9e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 
236 aa  242  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.56 
 
 
243 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  49.12 
 
 
245 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  49.56 
 
 
234 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  48.25 
 
 
241 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  49.33 
 
 
234 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
237 aa  224  6e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  49.32 
 
 
236 aa  224  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  48.86 
 
 
236 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  47.21 
 
 
244 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  52.94 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  48.86 
 
 
236 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  46.64 
 
 
234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  48.4 
 
 
236 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  48.03 
 
 
243 aa  218  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  51.35 
 
 
246 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  48.18 
 
 
244 aa  215  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.65 
 
 
228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  47.03 
 
 
236 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  47.49 
 
 
235 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.96 
 
 
225 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.96 
 
 
225 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
220 aa  201  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  45.62 
 
 
242 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  47.49 
 
 
235 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  46.02 
 
 
246 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  47.49 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
220 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.09 
 
 
256 aa  197  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.34 
 
 
232 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  43.61 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  44.1 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.79 
 
 
242 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
224 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
227 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  46.93 
 
 
254 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.99 
 
 
237 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.99 
 
 
237 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.98 
 
 
234 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.98 
 
 
234 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  43.23 
 
 
225 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.89 
 
 
233 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
229 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.44 
 
 
277 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
223 aa  188  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  45.13 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.89 
 
 
232 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  42.86 
 
 
228 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.53 
 
 
247 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 
237 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.08 
 
 
244 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  42.36 
 
 
233 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
239 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  41.92 
 
 
245 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
242 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  43.05 
 
 
237 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.41 
 
 
227 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  41.44 
 
 
229 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.89 
 
 
232 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  41.85 
 
 
225 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.64 
 
 
223 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.44 
 
 
230 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.34 
 
 
242 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 
233 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.34 
 
 
241 aa  184  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.56 
 
 
225 aa  184  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  43.3 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.92 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  40.27 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
232 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
227 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  41.99 
 
 
233 aa  182  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  41.7 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  41.82 
 
 
244 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  42.79 
 
 
280 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 
239 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  41.15 
 
 
244 aa  181  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  42.98 
 
 
253 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>