More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0686 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  59.46 
 
 
223 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  48.62 
 
 
225 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  48.62 
 
 
225 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  53 
 
 
224 aa  231  6e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  51.6 
 
 
231 aa  231  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  53.46 
 
 
224 aa  231  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
220 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  51.36 
 
 
225 aa  229  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
223 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
223 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  47.3 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  50 
 
 
229 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
228 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  49.31 
 
 
224 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.7 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
230 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.58 
 
 
230 aa  190  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  43.75 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  39.81 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.96 
 
 
242 aa  181  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.18 
 
 
227 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  40.19 
 
 
233 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  42.92 
 
 
233 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  38.25 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
227 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  42.86 
 
 
228 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.12 
 
 
229 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  47.06 
 
 
221 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  47.06 
 
 
221 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.28 
 
 
225 aa  176  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.28 
 
 
225 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
244 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.1 
 
 
235 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
229 aa  175  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  39.11 
 
 
249 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  40.36 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  41.82 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.52 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  39.19 
 
 
237 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
238 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
259 aa  171  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  38.43 
 
 
234 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.53 
 
 
226 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  41.44 
 
 
232 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 
221 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
235 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.54 
 
 
237 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  42.59 
 
 
244 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  38.18 
 
 
245 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  46.4 
 
 
235 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.37 
 
 
228 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  40.37 
 
 
240 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  37.44 
 
 
269 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
230 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  39.91 
 
 
243 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
230 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  41.89 
 
 
249 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  40.37 
 
 
236 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
244 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  36.45 
 
 
269 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  38.12 
 
 
232 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
255 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  41.26 
 
 
245 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
255 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  41.18 
 
 
231 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  39.35 
 
 
225 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
248 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
230 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3612  ABC transporter related  38.81 
 
 
231 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  43.38 
 
 
221 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.14 
 
 
264 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  41.63 
 
 
236 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  41.63 
 
 
236 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  41.63 
 
 
236 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  41.63 
 
 
236 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  39.82 
 
 
230 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
246 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
234 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.75 
 
 
252 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  38.29 
 
 
228 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  40 
 
 
234 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  40 
 
 
234 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
319 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  41.74 
 
 
243 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
221 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  39.82 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  37.9 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  36.57 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>