More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1311 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.75 
 
 
233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.75 
 
 
233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.75 
 
 
233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.75 
 
 
233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.75 
 
 
233 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
233 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  49.5 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  49.5 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
233 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.01 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 
227 aa  192  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  43.38 
 
 
234 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  43.38 
 
 
234 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.16 
 
 
236 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.15 
 
 
235 aa  189  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  42.79 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.7 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.55 
 
 
234 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.32 
 
 
235 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
227 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  43.58 
 
 
230 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 
234 aa  188  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  43.64 
 
 
256 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 
234 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.25 
 
 
232 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.53 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.41 
 
 
228 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.83 
 
 
235 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  42.79 
 
 
241 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.26 
 
 
231 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  44.75 
 
 
247 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 
234 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.44 
 
 
227 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
232 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 
227 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  40.99 
 
 
266 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  43.38 
 
 
235 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.51 
 
 
236 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
227 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.81 
 
 
234 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.09 
 
 
234 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  41.36 
 
 
237 aa  185  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  42.99 
 
 
227 aa  185  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 
227 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.09 
 
 
234 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  40.54 
 
 
233 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  43.69 
 
 
227 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  41.36 
 
 
230 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
248 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.54 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.54 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  43.95 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  46.27 
 
 
224 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  44.09 
 
 
232 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 
233 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  41.44 
 
 
241 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.44 
 
 
227 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.26 
 
 
230 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  42.2 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  41.89 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.78 
 
 
233 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45.77 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  44.55 
 
 
234 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  45.54 
 
 
235 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
228 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.29 
 
 
231 aa  180  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
408 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  44.28 
 
 
388 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.01 
 
 
230 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.53 
 
 
235 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.99 
 
 
242 aa  179  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.64 
 
 
231 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
229 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40.18 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  40.45 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  41.36 
 
 
238 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  38.18 
 
 
223 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  42.79 
 
 
388 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
643 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>