More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3626 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  58.93 
 
 
237 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  56.5 
 
 
229 aa  234  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  56.54 
 
 
235 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  57.47 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  56.11 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  54.63 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.3 
 
 
265 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
230 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.54 
 
 
252 aa  204  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  51.8 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.64 
 
 
259 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
223 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  42.2 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  43.58 
 
 
223 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  51.58 
 
 
232 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.67 
 
 
240 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  42.92 
 
 
228 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  42.42 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.78 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
264 aa  171  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
408 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  45.58 
 
 
277 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.86 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  38.18 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.73 
 
 
272 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  41.78 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  37.27 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  37.27 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  38.64 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  40 
 
 
232 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  41.36 
 
 
225 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.95 
 
 
646 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  43.52 
 
 
650 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  46.08 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  43.64 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  45.66 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
220 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  39.73 
 
 
233 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
235 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
234 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  41.01 
 
 
217 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.36 
 
 
227 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  40.65 
 
 
232 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  41.43 
 
 
232 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  39.11 
 
 
225 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  41.43 
 
 
232 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  40.19 
 
 
230 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  41.55 
 
 
245 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  42.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  40.48 
 
 
232 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 
235 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  43.81 
 
 
305 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  40.19 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  42.4 
 
 
655 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  46.61 
 
 
245 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.82 
 
 
255 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  37.9 
 
 
223 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  40.48 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  40 
 
 
229 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
232 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  38.01 
 
 
224 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  40.93 
 
 
235 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.11 
 
 
230 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  39.23 
 
 
234 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 
220 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.81 
 
 
230 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  39.23 
 
 
217 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  41.71 
 
 
238 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
218 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  42.38 
 
 
234 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.54 
 
 
235 aa  158  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1518  ABC transporter related  44.98 
 
 
222 aa  158  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  41.1 
 
 
234 aa  158  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
286 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  42.38 
 
 
240 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  38.01 
 
 
224 aa  158  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  36.87 
 
 
234 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
233 aa  158  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  41.47 
 
 
243 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  42.45 
 
 
246 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
260 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 
230 aa  157  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  41.55 
 
 
244 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>