More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0947 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  77.49 
 
 
233 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  79.02 
 
 
228 aa  364  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  76.52 
 
 
240 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  74.78 
 
 
244 aa  358  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  58.22 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
237 aa  234  7e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.55 
 
 
243 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  49.12 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  51.97 
 
 
246 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  48.25 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  52.49 
 
 
230 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  48.64 
 
 
236 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  48.64 
 
 
236 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  49.08 
 
 
243 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 
220 aa  204  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  46.19 
 
 
234 aa  204  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  48.86 
 
 
236 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.05 
 
 
233 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  45.98 
 
 
244 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.32 
 
 
228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  46.61 
 
 
244 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.16 
 
 
256 aa  201  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  47.49 
 
 
236 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
220 aa  197  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.11 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
229 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  45.87 
 
 
244 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.06 
 
 
225 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.06 
 
 
225 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.58 
 
 
246 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.05 
 
 
225 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  44.44 
 
 
235 aa  192  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.32 
 
 
653 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.44 
 
 
241 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.95 
 
 
249 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.24 
 
 
242 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.34 
 
 
232 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  43.75 
 
 
244 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
237 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.6 
 
 
234 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.6 
 
 
234 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  43.44 
 
 
249 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.05 
 
 
225 aa  189  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  49.77 
 
 
235 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  46.58 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
227 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  48.39 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
233 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.69 
 
 
648 aa  188  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.5 
 
 
237 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.5 
 
 
237 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.2 
 
 
227 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  44.95 
 
 
242 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.7 
 
 
277 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.25 
 
 
266 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
246 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.2 
 
 
227 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.89 
 
 
230 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.8 
 
 
239 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.52 
 
 
223 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
259 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
230 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
242 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.98 
 
 
226 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  43.86 
 
 
233 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
408 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  42.86 
 
 
223 aa  185  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
230 aa  184  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
223 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
226 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.98 
 
 
253 aa  184  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.54 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.2 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  42.24 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  44.26 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  42.86 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  43.75 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>