More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 259 aa  494  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  54.5 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.57 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  50 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  48.66 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.65 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  47.06 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  47.73 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  47.27 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  43.95 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  42.73 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  45.78 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  45.05 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  44 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  42.27 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  38.74 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  45.66 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  47.64 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  40.91 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  40 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  42.15 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  40.91 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  41.33 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  41.44 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  43.81 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  40.99 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  48.03 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  47.22 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.59 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  44 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.59 
 
 		 227 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  39.56 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  40.99 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  42.41 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  45 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  43.85 
 
 		 648 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  45.1 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  46.08 
 
 		 654 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  40.55 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  44.84 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  42.92 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.53 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  46.01 
 
 		 668 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  39.73 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  42.17 
 
 		 652 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  46.01 
 
 		 668 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  44.7 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  44.7 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  45.95 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.2 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  41.7 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  43.24 
 
 		 654 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  40 
 
 		 653 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  45.05 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  39.46 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  40.59 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  43.5 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.34 
 
 		 648 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  42.86 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.51 
 
 		 648 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.34 
 
 		 648 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.54 
 
 		 646 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 222 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  39.73 
 
 		 225 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  37.45 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  40.47 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.26 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  38.86 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.31 
 
 		 663 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  45.33 
 
 		 653 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  43.55 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>