More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1745 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  100 
 
 
229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
230 aa  277  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
229 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  53.95 
 
 
236 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  44.8 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.21 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  51.8 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  42.59 
 
 
223 aa  191  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 
230 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
250 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  47.84 
 
 
235 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
246 aa  184  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  49.32 
 
 
237 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  45 
 
 
671 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
259 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  44.8 
 
 
246 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  44.24 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.17 
 
 
277 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
233 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.99 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
233 aa  177  9e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  40.83 
 
 
234 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.25 
 
 
241 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.82 
 
 
644 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
252 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.29 
 
 
223 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.62 
 
 
228 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  46.46 
 
 
229 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
235 aa  176  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.18 
 
 
232 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  39.83 
 
 
238 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  44.8 
 
 
272 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
248 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  39.81 
 
 
223 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.44 
 
 
653 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.98 
 
 
231 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  43.69 
 
 
226 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45 
 
 
240 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45 
 
 
240 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45 
 
 
240 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.81 
 
 
226 aa  174  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  46.26 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  41.94 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.34 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.06 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  44.95 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.06 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  42.48 
 
 
661 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  42.27 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
233 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  45 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  42.73 
 
 
277 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.75 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  42.22 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  42.66 
 
 
224 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
266 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
228 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.8 
 
 
252 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  43.36 
 
 
650 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  44.39 
 
 
231 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  43.3 
 
 
230 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
235 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
221 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  42.86 
 
 
230 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  42.99 
 
 
654 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  42.86 
 
 
260 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  43.36 
 
 
233 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  40.65 
 
 
236 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  38.71 
 
 
231 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  40.1 
 
 
224 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  40.1 
 
 
224 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  42.47 
 
 
255 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
271 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.59 
 
 
230 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
232 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
233 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
233 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.3 
 
 
663 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  36.41 
 
 
225 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  42.72 
 
 
251 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>