More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2884 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  57.58 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  55.51 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.31 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  53.71 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  51.05 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  49.36 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  45.85 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  49.57 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.55 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.91 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  39.66 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  44.14 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.47 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  41.23 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  39.47 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  38.53 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  38.67 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  34.62 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.53 
 
 		 653 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  38.67 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  34.62 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  40.28 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.79 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  38.05 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  42.92 
 
 		 654 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  42.54 
 
 		 653 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  38.49 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.73 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  38.89 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  41.13 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  38.7 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.99 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  44.44 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  40.27 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  40.93 
 
 		 668 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.69 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  39.56 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  38.7 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.94 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.94 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0735  peptide ABC transporter ATPase  36.64 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.249205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  42.13 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.3 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  36.32 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  39.33 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  42.36 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  41.71 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  37.82 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  37.82 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  45.07 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  36.71 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  39.39 
 
 		 648 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  39.22 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  41.08 
 
 		 652 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  39.39 
 
 		 648 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.14 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  34.62 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.57 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  40 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  38.75 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  39.83 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  40.76 
 
 		 656 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  40.83 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>