More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2835 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  89.27 
 
 		 243 aa  424  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  83.77 
 
 		 234 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  82.68 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  82.25 
 
 		 236 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  85.28 
 
 		 236 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  82.25 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  82.25 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  82.25 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  81.7 
 
 		 241 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  80.52 
 
 		 234 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  81.82 
 
 		 236 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  81.39 
 
 		 236 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  81.82 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  79.22 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  79.91 
 
 		 243 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  79.13 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  79.57 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  83.84 
 
 		 244 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  82.68 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  77.06 
 
 		 234 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  80.52 
 
 		 235 aa  362  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  55.02 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  49.12 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  48.66 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  50.46 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  48.92 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  51.77 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  81.82 
 
 		 122 aa  198  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  50.9 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.21 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.21 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.1 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.64 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.62 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 223 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.35 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.09 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.67 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.15 
 
 		 649 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.15 
 
 		 649 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.45 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.73 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  44.21 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  44.35 
 
 		 652 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.73 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.95 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  43.5 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44.2 
 
 		 654 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  39.32 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.7 
 
 		 642 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.05 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 645 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  44.58 
 
 		 663 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  46.23 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  46.23 
 
 		 681 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.26 
 
 		 642 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  41.96 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.86 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  46.23 
 
 		 681 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.12 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.58 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  46.7 
 
 		 687 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.66 
 
 		 646 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.27 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  44.3 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 230 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.6 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  43.58 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  40.55 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.33 
 
 		 644 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.18 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  41.89 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  44 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  43.3 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>