More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3305 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  60.91 
 
 
230 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  51.79 
 
 
234 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 
236 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
237 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  51.14 
 
 
241 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  50.9 
 
 
245 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  48.89 
 
 
240 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  46.93 
 
 
233 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.33 
 
 
243 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.56 
 
 
244 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  49.78 
 
 
244 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
234 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  48.87 
 
 
228 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  49.33 
 
 
243 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  52.02 
 
 
234 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  49.54 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  50.46 
 
 
236 aa  198  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  48.88 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  48.88 
 
 
234 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  48.62 
 
 
236 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  48.62 
 
 
236 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  48.62 
 
 
236 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  48.17 
 
 
236 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  47.77 
 
 
235 aa  191  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  48.62 
 
 
236 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  49.55 
 
 
235 aa  184  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  47.71 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  47.71 
 
 
236 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  50.46 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
259 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
248 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  44.34 
 
 
246 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.61 
 
 
648 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
233 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.04 
 
 
228 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.79 
 
 
230 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.18 
 
 
223 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  40.59 
 
 
242 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
235 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
242 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  44.65 
 
 
240 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  44.09 
 
 
255 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  41.95 
 
 
250 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  41.32 
 
 
236 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.09 
 
 
888 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.17 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.6 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  39.27 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
643 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 
286 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  42.22 
 
 
241 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  45.7 
 
 
653 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  39.91 
 
 
250 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.57 
 
 
239 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  43.44 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  43.05 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  42.73 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  41.07 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 
649 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  41.26 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.39 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  40.45 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.48 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.93 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.7 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.44 
 
 
649 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
230 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.04 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.04 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  39.13 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  41.52 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  43.23 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  37.89 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  41.52 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.43 
 
 
241 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.91 
 
 
232 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  41.28 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.36 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.45 
 
 
230 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
227 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  41.44 
 
 
244 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  38.86 
 
 
242 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  41.41 
 
 
715 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  41 
 
 
643 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>