More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3251 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  89.08 
 
 		 234 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  83.12 
 
 		 243 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  85.28 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  83.55 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  83.55 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  83.55 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  83.12 
 
 		 236 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  82.68 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  82.25 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  80.6 
 
 		 241 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  80.95 
 
 		 236 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  79.22 
 
 		 234 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  79.57 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  80.52 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  80.87 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  79.65 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  80.09 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  83.12 
 
 		 235 aa  362  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  78.17 
 
 		 243 aa  361  6e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  82.53 
 
 		 244 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  79.22 
 
 		 235 aa  351  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  51.34 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  49.56 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  51.36 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  49.55 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  51.54 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  52.05 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  52.05 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.58 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  78.51 
 
 		 122 aa  191  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.3 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.33 
 
 		 649 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.33 
 
 		 649 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.44 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.44 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  43.24 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.09 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.12 
 
 		 648 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.26 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.54 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.78 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.73 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.23 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.55 
 
 		 642 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.36 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  42.79 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40.81 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.55 
 
 		 642 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  41.52 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.26 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.99 
 
 		 644 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  38.53 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  38.53 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  41.74 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.73 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  40.53 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 643 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  39.65 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  39.56 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  43.52 
 
 		 668 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  40.53 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  40 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  39.04 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  43.18 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  42.36 
 
 		 654 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.05 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  42.47 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.28 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.01 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  40.81 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  44.5 
 
 		 647 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>