More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1671 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  89.08 
 
 		 236 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  83.19 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  84.05 
 
 		 236 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  84.05 
 
 		 236 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  84.05 
 
 		 236 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  83.62 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  83.62 
 
 		 236 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  82.05 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  83.77 
 
 		 245 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  82.46 
 
 		 241 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  81.9 
 
 		 244 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  81.58 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  81.47 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  81.47 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  80.7 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  80.6 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  81.14 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  85.34 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  78.88 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  81.03 
 
 		 235 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  83.77 
 
 		 244 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  49.56 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  48.46 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  49.33 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  49.56 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  52.53 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  52.97 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  51.79 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  78.81 
 
 		 122 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.29 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.89 
 
 		 649 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.89 
 
 		 649 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.69 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.55 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  42.11 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.32 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.84 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.11 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 654 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  40.91 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.91 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.91 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.52 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  40.89 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.09 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  44.29 
 
 		 655 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  41.78 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  42.61 
 
 		 563 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.65 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  42.48 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  43.12 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.73 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.05 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.2 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.41 
 
 		 642 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  42.17 
 
 		 565 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  44.76 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.48 
 
 		 644 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  42.86 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.66 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.07 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40.97 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  45.33 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  43.48 
 
 		 647 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  43.44 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>