More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3406 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  86.67 
 
 		 244 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  83.69 
 
 		 233 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  84.89 
 
 		 228 aa  394  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  76.52 
 
 		 234 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  55.8 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.78 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  55.41 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  49.56 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  49.55 
 
 		 241 aa  224  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  50.45 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  48.92 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  48.23 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  48.71 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  48.28 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  52.49 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  50.67 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  47.84 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  49.09 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  46.98 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  47.03 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  48.66 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.35 
 
 		 228 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  47.49 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  47.95 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  48.4 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.97 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  49.33 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  45.74 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 231 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.32 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.81 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.34 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  44.5 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  44.05 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.34 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.73 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  46.49 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  42.86 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  44.39 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.78 
 
 		 653 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.89 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.11 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  46.05 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.11 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 		 242 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  40.77 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  44.14 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.86 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.34 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.89 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  41.74 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  41.52 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  43.75 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.66 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40.52 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  43.04 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  43.44 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  43.11 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  40.87 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.09 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.06 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>