More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03880 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 122 aa  247  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  91.74 
 
 		 236 aa  227  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  91.74 
 
 		 236 aa  227  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  91.74 
 
 		 236 aa  227  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  91.74 
 
 		 236 aa  227  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  91.74 
 
 		 236 aa  227  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  91.74 
 
 		 236 aa  224  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  89.26 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  90.08 
 
 		 236 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  90.08 
 
 		 236 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  88.14 
 
 		 236 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  84.75 
 
 		 244 aa  204  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  80.51 
 
 		 235 aa  203  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  82.5 
 
 		 244 aa  201  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  80.51 
 
 		 243 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  81.82 
 
 		 245 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  80 
 
 		 244 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  80.17 
 
 		 243 aa  194  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  79.17 
 
 		 234 aa  193  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  78.51 
 
 		 236 aa  191  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  80.51 
 
 		 234 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  78.81 
 
 		 234 aa  187  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  76.27 
 
 		 241 aa  186  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 237 aa  124  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  55.24 
 
 		 240 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  50.89 
 
 		 244 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  56.48 
 
 		 230 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  53.47 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  50.94 
 
 		 233 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  47.71 
 
 		 223 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2147  ABC transporter related  43.75 
 
 		 232 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.352493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.79 
 
 		 242 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44.76 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  45.45 
 
 		 247 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  42.11 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  50.93 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 240 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 240 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 223 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 223 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 223 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  49.5 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  49.5 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.5 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 247 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 247 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  47.12 
 
 		 241 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.65 
 
 		 240 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 		 233 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  44.55 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  44.55 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  43.48 
 
 		 228 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  47.27 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3775  ABC transporter related  46.3 
 
 		 301 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 219 aa  98.6  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.97 
 
 		 255 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.88 
 
 		 225 aa  98.6  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  52.83 
 
 		 235 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.88 
 
 		 225 aa  98.6  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  44.74 
 
 		 715 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  45.19 
 
 		 223 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.45 
 
 		 237 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.45 
 
 		 237 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.74 
 
 		 228 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 222 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 224 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 223 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  43.52 
 
 		 226 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  43.52 
 
 		 226 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  43.1 
 
 		 238 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 231 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  43.4 
 
 		 244 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 329 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.59 
 
 		 231 aa  97.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.13 
 
 		 228 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 252 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0911  hypothetical protein  44.64 
 
 		 225 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0880  hypothetical protein  46.3 
 
 		 225 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  43.81 
 
 		 226 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1685  ABC transporter related  43.69 
 
 		 237 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000384234  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.67 
 
 		 242 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.74 
 
 		 228 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.74 
 
 		 228 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  48.21 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>