More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1951 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1951  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  69.68 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  69.68 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  47.42 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  45.62 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.53 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.53 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  43.46 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  45 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40.64 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.74 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  39.82 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  41.74 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  41.74 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  39.91 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  40.27 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  41.74 
 
 		 647 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  36.36 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  41.33 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  44.95 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  39.27 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  42.2 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  41.47 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  42.2 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  42.2 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  42.66 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  42.2 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.72 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  42.66 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  39.55 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  42.67 
 
 		 241 aa  168  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  43.9 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 643 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  42.2 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.1 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  39.37 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  39.45 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  38.18 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  41.63 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  39.35 
 
 		 242 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.28 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  38.12 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  38.91 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  37.9 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  41.2 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  40.74 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.15 
 
 		 888 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  39.73 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.46 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  40.91 
 
 		 779 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  41.55 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  38.57 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  41.74 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  41.74 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  41.74 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  39.19 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  41.74 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  38.74 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  38.36 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  38.71 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.28 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  39.17 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.67 
 
 		 642 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  38.36 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.09 
 
 		 663 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.1 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.09 
 
 		 663 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  38.99 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  41.74 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>