More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3722 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  100 
 
 
779 aa  1595    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  52.4 
 
 
779 aa  801    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  38.38 
 
 
885 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.95 
 
 
888 aa  515  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  41.57 
 
 
903 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  41.98 
 
 
1090 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  62.46 
 
 
1130 aa  375  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.59 
 
 
950 aa  375  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.57 
 
 
1207 aa  317  8e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  44.38 
 
 
643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  40.56 
 
 
662 aa  256  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  44.03 
 
 
664 aa  245  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.46 
 
 
664 aa  239  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  29.28 
 
 
919 aa  232  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  40.67 
 
 
660 aa  228  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  48.2 
 
 
233 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  27.21 
 
 
893 aa  211  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.64 
 
 
230 aa  210  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.91 
 
 
653 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
221 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  39.68 
 
 
715 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  208  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39.03 
 
 
656 aa  208  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.08 
 
 
647 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.37 
 
 
237 aa  205  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  40.54 
 
 
641 aa  204  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
246 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.81 
 
 
232 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  37.16 
 
 
668 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  42.86 
 
 
242 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.61 
 
 
237 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  37.38 
 
 
657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  45.25 
 
 
256 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.5 
 
 
671 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  37.09 
 
 
653 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  38.26 
 
 
657 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.78 
 
 
239 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.25 
 
 
661 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  46.54 
 
 
660 aa  201  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.79 
 
 
642 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.74 
 
 
226 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.16 
 
 
642 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.12 
 
 
235 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.38 
 
 
652 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.05 
 
 
225 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.14 
 
 
648 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  35.47 
 
 
653 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 
222 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  37.97 
 
 
651 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.55 
 
 
293 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.09 
 
 
234 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.8 
 
 
241 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.64 
 
 
235 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
233 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  36.33 
 
 
657 aa  197  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.09 
 
 
234 aa  197  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  37.54 
 
 
656 aa  197  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  36.58 
 
 
648 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  36.58 
 
 
648 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
228 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.3 
 
 
663 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.5 
 
 
225 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.09 
 
 
240 aa  196  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  37.92 
 
 
653 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  42.27 
 
 
224 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  44.8 
 
 
241 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
230 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  47.09 
 
 
226 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.56 
 
 
228 aa  195  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.55 
 
 
252 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
240 aa  195  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
649 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  44.14 
 
 
226 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.39 
 
 
644 aa  194  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
233 aa  194  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.34 
 
 
244 aa  194  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  41.44 
 
 
237 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.49 
 
 
604 aa  193  8e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.55 
 
 
234 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.05 
 
 
236 aa  193  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.56 
 
 
649 aa  193  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  43.64 
 
 
241 aa  193  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  42.31 
 
 
247 aa  193  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.34 
 
 
239 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  36.45 
 
 
650 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
246 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  34.9 
 
 
648 aa  193  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.98 
 
 
663 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.81 
 
 
649 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  43.5 
 
 
229 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.38 
 
 
248 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  32.73 
 
 
647 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  34.22 
 
 
654 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
238 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.69 
 
 
225 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.38 
 
 
248 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  35.43 
 
 
652 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  42.34 
 
 
242 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  35.31 
 
 
652 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>