More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0008 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  83.11 
 
 
237 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  83.11 
 
 
237 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  70.93 
 
 
250 aa  339  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  69.96 
 
 
225 aa  333  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  68.44 
 
 
231 aa  323  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  68.16 
 
 
242 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  67.4 
 
 
237 aa  314  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  65.64 
 
 
244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  66.96 
 
 
237 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  63.88 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  65.45 
 
 
453 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  61.23 
 
 
231 aa  296  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  60.68 
 
 
246 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  54.95 
 
 
230 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  54.5 
 
 
230 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  57.92 
 
 
408 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  54.46 
 
 
229 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  55.71 
 
 
251 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  54.67 
 
 
227 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  54.42 
 
 
242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  54.91 
 
 
237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  54.46 
 
 
242 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  56.11 
 
 
237 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  54.46 
 
 
242 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  53.88 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  49.07 
 
 
217 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  52.94 
 
 
252 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  47.62 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  45.05 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.91 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.67 
 
 
230 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.99 
 
 
246 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.36 
 
 
232 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.05 
 
 
277 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.05 
 
 
230 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2748  ABC transporter component  46.15 
 
 
231 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00767275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  42.79 
 
 
244 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.67 
 
 
242 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.89 
 
 
233 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  42.73 
 
 
315 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
237 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
246 aa  184  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.22 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.67 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.22 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  42.29 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 
227 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.97 
 
 
239 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 
231 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
238 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.11 
 
 
230 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  41.07 
 
 
227 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  43.24 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  39.04 
 
 
644 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.07 
 
 
237 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.17 
 
 
238 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
229 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  43.69 
 
 
240 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.18 
 
 
237 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 
233 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  40.36 
 
 
241 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
234 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  43.3 
 
 
230 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 
234 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
264 aa  175  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  40.62 
 
 
233 aa  174  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  41.96 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  42.47 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.15 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  40.36 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  42.99 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  40.36 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  40.36 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  39.19 
 
 
563 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  43.86 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  40.36 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
224 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  41.85 
 
 
228 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  39.91 
 
 
250 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
224 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  41.96 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.82 
 
 
225 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  40.99 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  41.96 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  42.53 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  42.73 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>