More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3431 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  48.65 
 
 
242 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
238 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  53.7 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.1 
 
 
242 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  53.42 
 
 
236 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  48.87 
 
 
249 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  54.95 
 
 
215 aa  207  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
236 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  51.14 
 
 
236 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  50.23 
 
 
236 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  47.77 
 
 
239 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  51.6 
 
 
236 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  51.14 
 
 
236 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  51.14 
 
 
236 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  52.75 
 
 
235 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.92 
 
 
236 aa  201  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  50.94 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
229 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  46.43 
 
 
241 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  47.42 
 
 
284 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
231 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  41.58 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  46.23 
 
 
226 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  41.33 
 
 
230 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  41.54 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  36.97 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 
246 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  38.22 
 
 
239 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40.86 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.57 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.42 
 
 
245 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  38.46 
 
 
225 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  38.46 
 
 
225 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  39.9 
 
 
217 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  37.67 
 
 
252 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.57 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.57 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  37.85 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  37.5 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  36.32 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
237 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
237 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.78 
 
 
250 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  33.77 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  38.78 
 
 
252 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  36.73 
 
 
247 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2747  putative lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  38.57 
 
 
233 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  36.41 
 
 
228 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  38.65 
 
 
237 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  37.16 
 
 
219 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  39 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.23 
 
 
664 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  38.39 
 
 
258 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  37.85 
 
 
238 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  37.76 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  39.49 
 
 
228 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  39.49 
 
 
227 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  33.5 
 
 
234 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.32 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.32 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  36.84 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  36.73 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.32 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.32 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35.24 
 
 
240 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  38.97 
 
 
228 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  37.06 
 
 
230 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  39.18 
 
 
235 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  41.4 
 
 
228 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.32 
 
 
228 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.31 
 
 
232 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  39.49 
 
 
227 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  31.98 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.4 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  34.06 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.04 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>