More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1004 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.43 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.44 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  46.88 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.78 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  47.53 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 244 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.36 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.61 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  45.61 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.67 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  46.9 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.08 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  40.36 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  40.54 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  46.98 
 
 		 654 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  45.74 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  52.09 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.81 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 329 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  45.5 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.86 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.4 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.53 
 
 		 653 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.91 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.29 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.78 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.24 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  44.24 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.78 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  44.49 
 
 		 287 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.05 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.72 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  49.5 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.44 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  47.89 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.59 
 
 		 642 aa  185  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.98 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 319 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  43.69 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.38 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  47.75 
 
 		 661 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 		 229 aa  185  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  42.27 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 253 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  46.22 
 
 		 251 aa  184  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  41.28 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  42.48 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.56 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  45.58 
 
 		 654 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.41 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  44.08 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  41.55 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  41.7 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  45.73 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  44.81 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  44.81 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  44.81 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40.91 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  45.91 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.89 
 
 		 644 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>