More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00773 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  83.47 
 
 		 242 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  62.82 
 
 		 238 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  57.39 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  51.77 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  53.02 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  53.95 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  53.51 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  53.71 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  53.19 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  53.71 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  52.56 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  53.02 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  54.76 
 
 		 215 aa  234  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  52.84 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  52.27 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.22 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  48.65 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  49.56 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  45.37 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  45.61 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  45.85 
 
 		 284 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.71 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  39.81 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 230 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.58 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  37.1 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  37.93 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  37.67 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  37.67 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 228 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.8 
 
 		 228 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  39.71 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  37.81 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.3 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  39.27 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  40.18 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  38 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  40.72 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.16 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  40.18 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  36.32 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  40.61 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  36.32 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  38.31 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  38.31 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  38.86 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  39.73 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  38.14 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  39.7 
 
 		 408 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  38.91 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  34.84 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  35.75 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  38.92 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  40.19 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  39.59 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.07 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  36.87 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37.75 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 226 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  42.5 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  38.5 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.35 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  39.09 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  34.82 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  37.81 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  38.19 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  38.19 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  36.54 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  33.93 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  35.71 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  39.22 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  41.97 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>