More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0403 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  48.18 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.91 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  46.54 
 
 		 229 aa  205  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  46.54 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  48.84 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  47.66 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.25 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.25 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.17 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  47.71 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  47.73 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  46.36 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  45.29 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.45 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  45.91 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.79 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.79 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  48.17 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.79 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  46.08 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  45.79 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  48.37 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  48.79 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  45.33 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  45.33 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  45.33 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  45.33 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 248 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 288 aa  193  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  48.17 
 
 		 247 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  49.51 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  53.49 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  49.49 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  48.15 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.78 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  48.15 
 
 		 260 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.19 
 
 		 249 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  46.98 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  43.93 
 
 		 249 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 291 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  47.44 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.87 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  46.76 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  46.83 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  47.51 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.78 
 
 		 230 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.2 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  46.51 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  43.26 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  47.22 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  47.69 
 
 		 287 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 262 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  43.64 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.82 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.78 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.36 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  44.44 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.64 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  44.6 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.07 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  45.16 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>