More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0412 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0412  ATPase  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  79.45 
 
 		 252 aa  348  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  70.28 
 
 		 217 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  64.52 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  60.83 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  56.19 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  57.73 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  56.82 
 
 		 227 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  58.41 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  57.96 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  57.08 
 
 		 237 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  55.61 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  55.66 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  55.36 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  55.66 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  56.36 
 
 		 230 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  54.22 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  55.91 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  54.42 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  55.66 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  54.13 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  53.3 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  51.6 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  53.85 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  58.6 
 
 		 229 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  57.58 
 
 		 202 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  50.22 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  57.14 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  50.88 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  53.95 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  53.33 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.41 
 
 		 211 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  51.57 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  50.91 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  51.63 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  54.9 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  52.07 
 
 		 228 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.11 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  48.17 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  54.46 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  46.05 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  54 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  47.09 
 
 		 224 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 		 224 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  44.18 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  45.49 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.05 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  44.13 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  44.13 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  44.13 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  50.45 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  45.85 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.39 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  43.43 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  52.74 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  45.98 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  49.3 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  46.72 
 
 		 240 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  46.93 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.48 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.48 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  49.77 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.96 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  51.98 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.48 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  43.84 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.96 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  54.46 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.96 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  52.88 
 
 		 228 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  48.65 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  43.58 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  47.22 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  49.52 
 
 		 237 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  53.85 
 
 		 200 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  48.04 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1067  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 236 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  48.02 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  52.48 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  46.36 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  49.76 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.42 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  47.12 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.42 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>