More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0125 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  73.33 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  72.52 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  63.8 
 
 		 260 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  63.8 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  63.8 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  62.22 
 
 		 241 aa  270  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  61.84 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  64.09 
 
 		 231 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  64.93 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  61.88 
 
 		 235 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  64.93 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  65.4 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 235 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  60.45 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  65.4 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  62.96 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  59.73 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  61.26 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  59.28 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  63.03 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  59.28 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  59.91 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  60.27 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  61.82 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  61.61 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  63.8 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  58.15 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  62.9 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  62.9 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  57.71 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  64.5 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  62.72 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  56.46 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  58.64 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  53.74 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.5 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.12 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  52.07 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  50.45 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  50.45 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  47.95 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.54 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.54 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.54 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.54 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.54 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  47.98 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.05 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.64 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  47.51 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  52.8 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  49.1 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  64.88 
 
 		 174 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  52.2 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  47.98 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  50.23 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  47.96 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.09 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  52.04 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  50.87 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  51.22 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  52.02 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.15 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  48.66 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  51.23 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  51.23 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  51.23 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  50.23 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>