More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2678 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  74.03 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  77.63 
 
 		 229 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  82 
 
 		 202 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  77.63 
 
 		 229 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  75.88 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  65.79 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  65.77 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  65.79 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  66.36 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  67.28 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  65.02 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  66.52 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  62.88 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  65.65 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  66.06 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  65.2 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  62.78 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  59.91 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  63.96 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  64.41 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  62.93 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  62.39 
 
 		 260 aa  268  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  62.39 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  64.89 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  60.19 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  59.39 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  62.72 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  57.33 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  58.04 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  58.45 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  56.65 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  56.22 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  53.33 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  61.9 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.91 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  56.34 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  53.24 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  68.24 
 
 		 174 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.59 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  49.32 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.59 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  53.12 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.94 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.04 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  55.46 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  52.11 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  47.75 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  49.77 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  48.42 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  53.57 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  53.21 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  51.57 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  51.13 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  53.12 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  51.12 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  52.23 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  54.21 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  51.97 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  54.04 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  53.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  52.84 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  55.72 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  50.46 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  51.11 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  49.33 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  53.92 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  50.22 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.88 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>