More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0549 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  90.8 
 
 		 240 aa  322  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  91.76 
 
 		 246 aa  313  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  90.75 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  89.41 
 
 		 247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  88.51 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  90.59 
 
 		 246 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  75.72 
 
 		 231 aa  261  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  75.58 
 
 		 227 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  76.3 
 
 		 231 aa  259  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  75 
 
 		 230 aa  256  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  75 
 
 		 260 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  76.16 
 
 		 228 aa  253  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  73.53 
 
 		 211 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  76.05 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  69.59 
 
 		 235 aa  250  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  69.01 
 
 		 235 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  68.97 
 
 		 235 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  71.01 
 
 		 239 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  73.53 
 
 		 237 aa  234  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  68.82 
 
 		 230 aa  234  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  67.65 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  68.05 
 
 		 242 aa  228  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  68.05 
 
 		 242 aa  228  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  66.09 
 
 		 242 aa  228  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  67.25 
 
 		 237 aa  221  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  64.12 
 
 		 217 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  65.48 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  64.5 
 
 		 233 aa  217  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  65.68 
 
 		 234 aa  213  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  60.71 
 
 		 228 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  64.5 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 227 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  64.88 
 
 		 228 aa  204  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  68.24 
 
 		 234 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  60.95 
 
 		 252 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  59.65 
 
 		 234 aa  200  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  60.36 
 
 		 219 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  58.58 
 
 		 219 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  58.82 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  62.11 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  64.94 
 
 		 229 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  65.52 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  65.52 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  58.29 
 
 		 249 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  59.52 
 
 		 227 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  57.14 
 
 		 228 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  60.12 
 
 		 228 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  60.48 
 
 		 235 aa  194  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  59.52 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  58.93 
 
 		 227 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  58.33 
 
 		 237 aa  192  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  54.76 
 
 		 224 aa  191  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  55.42 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  59.01 
 
 		 227 aa  190  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  61.01 
 
 		 227 aa  190  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  59.01 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  59.52 
 
 		 233 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  52.98 
 
 		 246 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  57.14 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  57.74 
 
 		 250 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  56.47 
 
 		 243 aa  187  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 239 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 		 246 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  55.29 
 
 		 224 aa  185  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  58.43 
 
 		 233 aa  184  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  57.23 
 
 		 236 aa  183  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  54.86 
 
 		 243 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  55.95 
 
 		 233 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  52.98 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  59.63 
 
 		 227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  55.36 
 
 		 230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  52.38 
 
 		 249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  55.29 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  57.76 
 
 		 239 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  56.55 
 
 		 224 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  54.71 
 
 		 234 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04661  ABC transporter ATP-binding protein  59.26 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0165379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  51.79 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  51.48 
 
 		 247 aa  180  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  180  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  180  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  180  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  180  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.88 
 
 		 228 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  55.36 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  51.19 
 
 		 251 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  51.79 
 
 		 227 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>