More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1200 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1200  ABC transporter related  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31235  normal  0.0871936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1447  ABC transporter related  49.76 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.330197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1678  ABC transporter related  48.02 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4817  Sigma 54 interacting domain protein  42.79 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3619  ABC transporter related  40.91 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272559  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1146  ABC transporter related  45.24 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.5 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  42.36 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.46 
 
 		 252 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2812  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340042  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  39.04 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  42.2 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  40.55 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  35.48 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  44.33 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  45.54 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  42.55 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.91 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  41.36 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  42.79 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  35.48 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  40.83 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  40.64 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  40.2 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  36.04 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.14 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  38.74 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.08 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  38.01 
 
 		 681 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  45.83 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  38.01 
 
 		 681 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  34.55 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4787  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  37.56 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  37.39 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  37.39 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  38.01 
 
 		 306 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  41.21 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  40.64 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  42.55 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.8 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.35 
 
 		 259 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  42.2 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.1 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  35.75 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  35.65 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  45.98 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  45.5 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  41.18 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  38.97 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  38.05 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  42.33 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  39.59 
 
 		 655 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  43.15 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.5 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  37.56 
 
 		 687 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  40.11 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  36.92 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  41.43 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  36.75 
 
 		 388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  44.27 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.07 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  36.41 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  42 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>