More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2073 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  100 
 
 
236 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2130  ABC transporter-like protein  70.39 
 
 
207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  52.08 
 
 
261 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.47 
 
 
233 aa  175  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.51 
 
 
223 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
249 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 
234 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.54 
 
 
236 aa  166  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.38 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
233 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 
233 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.85 
 
 
233 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.44 
 
 
227 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.99 
 
 
280 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.63 
 
 
238 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  42.05 
 
 
226 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.92 
 
 
227 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 
258 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
245 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  46.04 
 
 
231 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  46.04 
 
 
231 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.57 
 
 
258 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.17 
 
 
225 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  44.51 
 
 
224 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
233 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  47.12 
 
 
232 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
233 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
233 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
233 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
233 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  43 
 
 
242 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  43.09 
 
 
232 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  44.81 
 
 
255 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.78 
 
 
226 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
230 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 
408 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  47.03 
 
 
230 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  44.26 
 
 
255 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  44.44 
 
 
220 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  45.6 
 
 
253 aa  154  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 
232 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 
226 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.61 
 
 
230 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.68 
 
 
228 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.49 
 
 
255 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.06 
 
 
235 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 
226 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.03 
 
 
227 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
225 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.07 
 
 
228 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
234 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
235 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  43.62 
 
 
249 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  43.75 
 
 
225 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.71 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45.7 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  44.51 
 
 
445 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  39.71 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.25 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 
219 aa  152  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
281 aa  152  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
243 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 
227 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 
235 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.53 
 
 
227 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  45.36 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  44.02 
 
 
246 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
256 aa  151  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.92 
 
 
265 aa  151  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.46 
 
 
238 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 
224 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  46.37 
 
 
200 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  41.36 
 
 
228 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
221 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 
236 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  41.29 
 
 
238 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.22 
 
 
221 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  40.88 
 
 
227 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  44.27 
 
 
244 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  43.89 
 
 
228 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.49 
 
 
230 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  41.67 
 
 
224 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>